Manuel Gonzalo Claros Díaz

Catedrático

Mejora Genética y Biotecnología

Resumen

La bioinformática combina el poder de los ordenadores, los algoritmos matemáticos y la estadística con conceptos de las ciencias de la vida para resolver problemas biológicos, por lo que es crucial para la investigación con plantas. Nos dedicamos a apoyar la aceleración de la mejora genética y a conocer mejor las vías de regulación (y las posibles tolerancias) a las agresiones bióticas y abióticas. Así, hemos desarrollado herramientas bioinformáticas para 1) automatizar los análisis de RNA-seq, 2) detectar variaciones genéticas a partir de RNA-seq en poblaciones de virus, bacterias y plantas, y 3) comparar genomas bacterianos. Con ello hemos colaborado en la intervención del óxido nítrico en la maduración del pimiento dulce, la adaptación a la salinidad en los cítricos, qué funciones celulares de los mohos pulverulentos son clave para la patogenia, así como el estudio del polen, pistilo y semillas de olivo para mejorar su productividad y como fuente de alérgenos.

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PUBLICACIONES SELECCIONADAS

An improved de novo assembling and polishing of Solea senegalensis transcriptome shed light on retinoic acid signalling in larvae J. Córdoba-Caballero, P. Seoane, F.M. Jabato, J.R. Perkins, M. Manchado, M.G. Claros

Scientific Reports, 2020, 10:20654

Gene expression profile of Mexican lime trees in response to inoculation with Candidatus Liberibacter asiaticus
Arce-Leal AP, Bautista R, Rodríguez-Negrete EA, Manzanilla-Ramírez MA, Velázquez-Monreal JJ, Santos-Cervantes ME, Méndez-Lozano J, Beuzón CR, Bejarano ER, Castillo AG, Claros MG, Leyva-López NE

Microorganisms, 2020, In press

The haustorial transcriptome of the cucurbit pathogen Podosphaera xanthii reveals new insights into the biotrophy and pathogenesis of powdery mildew fungi Polonio A, Seoane P, Claros MG, Pérez-García A

BMC Genomics, 2019, 20:543

Nitric oxide-dependent regulation of sweet pepper fruit ripening S. González-Gordo, R. Bautista, M.G. Claros, A. Cañas, J.M. Palma, F.J. Corpas

J. Exp. Bot., 2019, 70: 4557–4570

TransFlow: A modular framework for assembling and assessing accurate de novo transcriptomes in non-model organisms Seoane P, M Espigares, R Carmona, A Polonio, J Quintana, E Cretazzo, J Bota, A Pérez-García, JD Alché, L Gómez, MG Claros

BMC Bioinformatics, 2018, 19 (Suppl. 14): 416