La Comisión Científica Asesora, es un órgano consultivo independiente del IHSM formado por investigadores de reconocido prestigio internacional en áreas relacionadas con el trabajo desarrollado en el Instituto: Mejora Genética y Biotecnología, Fruticultura, Interacción Planta-Microorganismo-Insecto y Protección de Cultivos. La comisión evalúa periódicamente la actividad científica y a los grupos del IHSM y asesora sobre las actividades y planes científicos y tecnológicos del Instituto.
Alon Samach The Robert H. Smith Institute of Plant Sciences and Genetics in Agriculture, The Hebrew University of Jerusalem, Jerusalen, Israel
Fernando García Arenal Centro de Bioteconología y Genómica de Plantas (CBGP) UPM-INIA, Madrid, España
Ignacio Romagosa Universidad de Lleida, Lleida, España
Leo Eberl University of Zurich, Zurich, Switzerland
Nicole van Dam German Centre for Integrative Biodiversity Research, Leipzig, Alemania
Stephane Blanc CIRAD, INRA, Montpellier, Francia