Metabolómica

Los metabolitos son moléculas de bajo peso molecular (menor que 1500 Da) que actúan como intermediarios o productos finales del metabolismo celular. En Fisiología vegetal, los principales rasgos, como la fotosíntesis, nutrición, respiración y transpiración, actividad hormonal, etc., están directamente relacionados con la presencia o ausencia de combinaciones específicas de metabolitos. Es importante destacar que, a menudo, es esta combinación de metabolitos, más que la presencia de compuestos individuales, la que tiene mayor relevancia biológica.

De este modo, las técnicas de metabolómica de alta resolución nos pueden ofrecer una visión lo más amplia posible de la composición bioquímica de los materiales biológicos sin la necesidad de disponer de conocimientos metabólicos previos. La Plataforma de Metabolómica (MetaboIHSM) es un servicio de investigación creado para dar servicios analíticos y de apoyo científico-técnico a los cuatro departamentos del IHSM (Mejora Genética y Biotecnología, Fruticultura Subtropical y Mediterránea, Interacción Panta-Microorganismo-Insecto y Microbiología y Protección de Cultivos), así como a los diferentes grupos de investigación de la Universidad de Málaga y a otras instituciones públicas o privadas.

Servicios

ANÁLISIS DE METABOLITOS PRIMARIOS (GC-MS)

Los metabolitos primarios de las muestras vegetales (azúcares, aminoácidos, ácidos orgánicos,Tabla 1) se analizan mediante cromatografía de gases acoplada a espectrometría de masas.

El Servicio ofrece:
  • Extracción y derivatización de muestras.
  • Inyección de las muestras en el sistema GC-MS.
  • Identificación y cuantificación relativa de los metabolitos disponibles en la base de datos del Servicio.

Tabla 1. Lista de Metabolitos primarios incluidos en el servicio.
AMINOÁCIDOS AZÚCARES ÁCIDOS ORGÁNICOS POLIALCOHOLES
Histidina D-(+)-Glucosa Ácido Málico Glicerol
Isoleucina D-(-)-Fructosa Ácido Cítrico Xilitol
Leucina Sacarosa Ácido Fumárico
Lisina Xylosa Ácido Succínico
Metionina Maltosa Ácido Galacturónico
Fenilalanina Maltotriosa Ácido Glucurónico
Treonina Isomaltosa
Triptófano Trehalosa
Valina Raffinosa
Alanina Rhamnosa
Arginina
Asparagina
Ácido aspártico
Ácido glutámico
Glutamina
Glicina
Prolina
Serina
Hidroxiprolina
Tirosina
GABA
β-alanina

Tarifas

Metabolitos primarios mediante GC-TOF-Masas
(GC-Agilent 7890B y TOF Masas-Leco)		 Metabolitos primarios (hasta 10 moléculas) Metabolitos primarios (perfil completo)
IHSM-UMA 22 31
CSIC-UNIVERSIDADES 32.5 41
ORGANISMOS PÚBLICOS 52 61
EMPRESAS 90 110
Tarifas por muestra / réplica (sin IVA)
El precio incluye preparación de muestra y análisis de resultados*
*en caso de no requerirlos, descontar 10 euros a los precios indicados

Muestras

Actualmente, en el Laboratorio de Metabolómica del IHSM (MetaboIHSM), se dispone de protocolos para el procesamiento (extracción, derivatización, etc) de las siguientes matrices de muestras vegetales: fruto, hoja, raíz, tallo.


Las muestras para ser aceptadas por el servicio de metabolómica han de cumplir los siguientes requisitos:


  • 1. El usuario ha de informar detalladamente del origen de la muestra (especie vegetal), matriz (hoja, fruto, raiz), cantidad (número total de muestras), y precauciones recomendadas en el manejo.
  • 2. Las muestras han de estar rotuladas de forma inequívoca para su perfecta identificación.

Equipamiento

Dentro de la Plataforma de Metabolómica del IHSM (Metabo-IHSM, Figura 1), hemos establecido un servicio para análisis metabolómicos dirigidos a gran escala. Esta plataforma comprende un sistema basado en masas -MS- en el que se utiliza la GC (cromatografía de gases) para la separación inicial de extractos complejos. Concretamente, en la actualidad se dispone de:

  • Cromatógrafo de Gases: Agilent 7890B GC System acoplado a un detector Pegasus® HT High Throughput TOF-MS (Figura 2).
Figura 1. Laboratorio de Metabolómica del IHSM (Metabo-IHSM).


Figura 2. Agilent 7890B GC System acoplado a un detector Pegasus® HT High Throughput TOF-MS

REGLAS GENERALES

Pasos a seguir para solicitar una analítica al Servicio de Metabolómica:


Usuarios internos

  • 1. Solicitar el servicio a través de la aplicación de reservas en la web del IHSM en https://www.ihsm.uma-csic.es/reservas incluyendo:
    • Datos de contacto
    • Breve resumen del diseño experimental
    • Tipo de análisis solicitado
    • Nombre y peso exacto de las muestras
    • Enviar asimismo información ampliada a: cterrient@uma.es
  • 2. Reunión previa con la Responsable Científica (Sonia Osorio) y el Responsable Técnico (Carlos Terriente).
  • 3. Una vez aceptada la solicitud, entregar las muestras al Servicio.
  • 4. Las muestras se procesarán según pedido en: https://www.ihsm.uma-csic.es/reservas

Usuarios externos

  • 1. Solicitar el servicio a través de correo electrónico a cterrient@uma.es incluyendo la siguiente información:
    • Datos de contacto
    • Breve resumen del diseño experimental
    • Tipo de análisis solicitado
    • Nombre y peso exacto de las muestras
  • 2. Los usuarios externos recibirán un formulario de pedido, que deberán devolver firmado y sellado. Las muestras se procesarán una vez recibida la hoja de pedido.
  • 3. Al finalizar el trabajo, recibirán un albarán de entrega, que también deberá ser devuelto firmado y sellado.
  • 4. A continuación, se emitirá la factura.

El material a analizar debe entregarse triturado y congelado en hielo seco o nitrógeno líquido.
Consultar previamente la cantidad de muestra necesaria en función del tipo de análisis.

Dirección

Actualmente, la Plataforma de Metabolómica del IHSM (Metabo-IHSM) se encuentra situada en el Laboratorio C05 del edificio del IHSM en el campus de Teatinos de la Universidad de Málaga.

IHSM Teatinos
Av. Louis Pasteur, 49.
29010 MÁLAGA
951953316

Personal

Responsable Científica:
Sonio Osorio


Responsable Técnico:
Carlos Terriente (cterrient@uma.es)