En la naturaleza, las plantas pueden interaccionar con diversos tipos de microorganismos beneficiosos que favorecen la eficiencia del uso del agua y de los nutrientes en las plantas, aumentando la tolerancia a situaciones ambientales adversas. La utilización de este tipo de microorganismos proporciona una alternativa ecológica a la aplicación de fertilizantes agroquímicos. En este contexto, comprender los procesos de colonización, establecimiento y funcionalidad de estas interacciones beneficiosas planta-microorganismo se presenta como una tarea necesaria para la posterior aplicación de estos microorganismos y, por tanto, para la explotación de los beneficios que produce en la planta. El conocimiento generado permitirá optimizar el rendimiento y la calidad de los cultivos mediante el desarrollo de estrategias agrícolas eco-sostenibles y ambientalmente responsables.