Un grupo de investigadores del IHSM desarrollan OliveAtlas, una herramienta que recoge la expresión génica del olivo conocida hasta ahora.

El grupo de científicos liderado por el investigador del IHSM La Mayora UMA-CSIC Noé Fernández-Pozo y por el catedrático de Biología Molecular y Bioquímica por la Universidad de Málaga y también profesional del centro mixto Gonzalo Claros, ha desarrollado la plataforma OliveAtlas (https://www.oliveatlas.uma.es/) para reunir toda la información genómica disponible de la variedad Picual del olivo para que esté a disposición de la comunidad científica. En la actualidad se han secuenciado hasta cinco genomas del olivo que van desde variedades silvestres hasta otras interesantes para la producción de aceite o la adaptación al medio, como la mencionada Picual, de enorme importancia económica en España. Sin embargo, hasta ahora no existía ningún repositorio que facilitara la investigación básica en este campo de estudio, ni tampoco la mejora genética del olivo. El OliveAtlas es una plataforma interactiva que contiene datos de expresión génica de la variedad Picual del olivo, con la ventaja de que se pueden aplicar desde la propia web distintas herramientas bioinformáticas y métodos de visualización que permiten la comparación múltiple de genes, la búsqueda de duplicaciones génicas, el enriquecimiento de conjuntos de genes y la descarga de los datos transcriptómicos. El desarrollo del OliveAtlas se basa en una herramienta ya existente (EasyGDB, también desarrollada por este equipo) que facilita el desarrollo de este tipo de atlas de expresión. Para el desarrollo del OliveAtlas, no solo han intervenido Noé Fernández Pozo, M. Gonzalo Claros y Amanda Bullones del IHSM-CSIC-UMA, sino que ha sido el fruto de una estrecha colaboración con investigadores del grupo de Biología Reproductiva y Microscopía Avanzada de Plantas (BReMAP) de la Estación Experimental Zaidín (CSIC), así como del Instituto Universitario de Investigación en Olivar y Aceites de Oliva de la Universidad de Jaén.

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