Realizan un estudio de genómica comparativa de Pseudomonas syringae pv. syringae, bacteria fitopatógena que afecta al cultivo del mango

Un equipo de investigadores del IHSM La Mayora ha realizado un trabajo de genómica comparada para profundizar en el conocimiento genético de Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss), bacteria responsable de la necrosis apical del mango, enfermedad limitante de este cultivo en la región mediterránea. Esta bacteria presenta un amplio contenido de genes relacionados con factores de virulencia, además de genes de adaptación, como son los genes de resistencia a cobre, detectados en elementos genéticos móviles. Hasta la fecha solo se disponía de información del genoma de tres cepas de Pss aisladas de mango, por ello este equipo ha llevado a cabo la secuenciación del genoma de otras 18 cepas de Pss para comparar su contenido genético. Para llevar a cabo la anotación de los genes presentes en estas 18 cepas se ha utilizado la herramienta Prokaryotic Genome Annotation Pipeline de NCBI junto al software Prokka. Gracias al análisis de estas 18 cepas junto con las tres que se disponía previamente, se ha identificado 4.106 que están presentes en todas las cepas, y que componen el núcleo del genoma de Pss aisladas de mango. Utilizando las secuencias de estos genes del núcleo del genoma, han llevado a cabo un análisis filogenético observándose la presencia de diferentes subgrupos filogenéticos donde se observa una correlación elevada entre cepas sensibles y cepas resistentes a cobre. Este trabajo sienta las bases para conocer en profundidad los mecanismos genéticos relacionados con la virulencia y la adaptación de esta bacteria patógena en su hospedador natural, el mango. En este trabajo ha participado el catedrático de Microbiología Antonio de Vicente, el catedrático de Microbiología Francisco Cazorla, el catedrático de Genética Cayo Ramos, el catedrático de Biología Molecular y Bioquímica Gonzalo Claros y los investigadores del IHSM La Mayora José A. Gutiérrez, Zaira Heredia, Adrián Pintado y la investigadora de SCBI-UMA Lorena Aguilera-Cobos.

Ir a la noticia