microDISCOVER: Microbial-based platform for the discovery of novel biocontrol agents and natural compounds

El proyecto microDISCOVER tiene como objetivo explorar los suelos supressivos de enfermedades, los cuales protegen a las plantas de infecciones causadas por patógenos fúngicos presentes en el suelo. La supresión del suelo es mediada por la actividad antagonista de las comunidades microbianas asociadas a las raíces. Un aspecto significativo de esta supresión involucra la producción de metabolitos secundarios por parte de bacterias asociadas al suelo, incluyendo péptidos no ribosomales (NRPS) y poliquetidos (PKS). Estos metabolitos secundarios desempeñan un papel crucial en las interacciones entre especies, contribuyendo al control de enfermedades y fomentando la salud y el desarrollo de las plantas. La hipótesis del proyecto sugiere que al integrar un enfoque multidisciplinario, combinando métodos independientes del cultivo, como la secuenciación funcional de amplicones, con técnicas de biología computacional y microbiología molecular, se puede establecer una base de datos completa de aislados bacterianos asociados a las raíces con potencial actividad de biocontrol y metabolitos secundarios novedosos. Los principales objetivos del proyecto microDISCOVER son los siguientes: - Implementar un enfoque exhaustivo e independiente del cultivo, utilizando la secuenciación funcional de amplicones, para perfilar los NRPS y PKS de las comunidades bacterianas asociadas a las raíces de plantas de tomate desafiadas con y sin un patógeno. - Emplear herramientas de biología computacional para analizar e interpretar los datos de secuenciación, identificando taxas microbianas clave que albergan NRPS y PKS novedosos con potencial actividad de biocontrol y altas perspectivas para producir metabolitos secundarios novedosos. - Aplicar técnicas de microbiología molecular de vanguardia para aislar y caracterizar cepas bacterianas asociadas a las raíces que demuestren un fuerte potencial de biocontrol y propiedades bioactivas prometedoras in vitro. - Establecer una base de datos pública, integrada y fácilmente consultable, que albergue información detallada de los aislados bacterianos asociados a las raíces identificados, su eficacia de biocontrol y los perfiles químicos de sus metabolitos secundarios. Al lograr estos objetivos, el proyecto busca generar conocimientos valiosos sobre el papel del microbioma asociado a las raíces en el biocontrol y el potencial para descubrir nuevos compuestos antimicrobianos. La base de datos integral servirá como un recurso valioso para futuras investigaciones en los campos del biocontrol y la búsqueda de aplicaciones biotecnológicas, y contribuirá a avanzar en la comprensión de la ecología microbiana y el desarrollo de prácticas agrícolas sostenibles.