Científicos crean “EasyGDB”, una herramienta bioinformática gratuita y customizable para crear portales genómicos de un modo sencillo.

El investigador Ramón y Cajal del IHSM La Mayora UMA-CSIC Noé Fernández Pozo junto al científico Aureliano Bombarely del IBMCP (CSIC) ha creado la herramienta bioinformática “EasyGDB”, un sistema customizable y muy accesible para gestionar datos genómicos de cualquier especie. Fernández Pozo ha señalado que esta herramienta ofrece la posibilidad de crear portales genómicos tanto de forma local como en una web de acceso público. Una plataforma en la que se pueden importar datos genómicos y que provee herramientas bioinformáticas y plantillas customizables de las páginas web necesarias para poder crear y gestionar “tu propio portal web genómico con tus datos, que puede ser accesible de modo público o privado para compartir resultados con la comunidad científica o únicamente para los miembros de un proyecto”. “EasyGDB” cuenta con herramientas bioinformáticas para analizar datos genómicos, visualizar datos de expresión, y para compartir de un modo sencillo información general de la especie u otra información interesante de la investigación, dando lugar así a un portal web que cada usuario completa con sus datos de investigación y que puede compartir con la sociedad de manera fácil y gratuita. “La plataforma ya ha sido utilizada por ejemplo para crear el portal web de los genomas del mango (MangoBase), y de la variedad Picual del olivo (OliveTreeDB)”, ha señalado el investigador, que ha avanzado que ya trabaja en la publicación del genoma del chirimoyo y otros subtropicales usando EasyGDB. Fernández Pozo ha señalado que puede utilizarse para proyectos de una sola especie o de múltiples especies, ofreciendo las herramientas bioinformáticas básicas necesarias para este tipo de proyectos y con la posibilidad de conectarlo con otras bases de datos. El trabajo, publicado en la revista Bioinformatics, ha sido desarrollado durante los últimos tres años por Fernández Pozo y Bombarely, que además han realizado vídeo tutoriales en YouTube para mostrar las posibilidades de esta nueva herramienta https://www.youtube.com/playlist?list=PL7jt0JZOquU7nAkIfbJN2jmnExeKC6Qpq

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